但是偶尔，也有一些程序失控，出现了一些无法预料的事情。就比如有人见到了幽灵，鬼魂，有人看见了吸血鬼，狼人这种无法用科学解释的生物。
这些，都是某些程序出现了差错，在矩阵中影射出来的现象。
而这时，这些程序会被矩阵系统删除，然后化为本源回到矩阵的主机。
在尼奥告诉先知自己梦到安妮死亡的画面时，先知就告诉他，这是又一个属于他的选。还告诉尼奥，但他回到矩阵的源头时，他就能明白这一切。
到时候，他会在那里做出选择。
一旦失败，下场....就是锡安的毁灭！
先知这番话让观众们听着有点玄乎...
救世主的使命就是回到系统的源头？
这什么意思？难道尼奥也是一个程序？
一个披着人类外衣的程序？？？
一想到这种可能，很多人的小心脏都是一突变得慌乱起来......
........
最后，先知告诉尼奥，叫他去寻找一个开锁匠。在他的手上，有通往矩阵源头的钥匙。
说完，先知便在狄昂的保护下离开。下一秒，大反派雨果出现。
而且不仅是一个，是一群。
拥有复制能力的他，无限侵蚀别人，将别人变成了自己。
然后利用人数优势和尼奥大战！
单挑可以，你一个人单挑我们一群。群挑也可以，我们一群群挑你一个。