传闻神农在人间暴毙，以致兽族受人、神欺压。
数万年后。
伏羲自封天帝，建立等级制度，规定神族统治人间。
神族渐渐腐败，人类终于爆发起义。
天帝下令镇压遭到人类顽强抵抗，天帝恼怒，下令天后女娲毁灭人类，重新创造敬神的新人类。
女娲抗命不从，并下凡来维护人类。
天帝开除女娲的神籍。
女娲也率领人类对抗神界。
千年后。
共工引天河水下人界，女娲阻洪水。
溪风和水碧在洪水中用天空城收容残余人族，轩辕剑在洪水后下落不明。
残存人类的命运得到挽救。
天帝省思后觉得神族也有不对之处，于是下令所有神族回到天界，封闭天界之门，神不得任意到人界。
从此人神二界完全隔绝，
女娲阻洪水，补天。
不久后力竭死去。
地皇神农和人皇女娲回归天地。
自此以后。